最近有许多小伙伴们念念知说念奈何查找基因的5'UTR、3'UTR、内含子和外显子母狗 拳交。尤其是在看了往期稿子:荧光素酶叙述(luciferase reporter)在microRNA规划中的哄骗
小初足交因为microRNA靶向的是基因的3'UTR,念念作念这个执行的问题等于不知说念奈何找基因的3'UTR。
今天就带来保姆级的查找基因的5'UTR、3'UTR、内含子和外显子的要津教程,人人照着每步的箭头开导操作就行了。
(1)大开NCBI,将搜索骨子遴荐为Gene,以东说念主源的IL-10基因为例,输出IL-10 human,点search。
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(2)搜索出来的第一条等于咱们需要的东说念主源的IL-10基因。点进去。
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(3)点进去之后是这么,然后往下拉。
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(4)找到右上角的tools。
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(5)找到tools内部的“sequence text view”,点进去就能看到基因的通盘序列信息了。
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(6)搜索效果奈何看?
蓝色标识的是5'UTR或3'UTR。红色标识的是外显子,因为外显子要翻译成氨基酸,是以底下会给出对应的氨基酸序列。绿色标识的是内含子,内含子不翻译,是以底下莫得氨基酸序列。这里标识的神气是网站自动给出来的。如若页面上莫得表示出来齐备的5'UTR或3'UTR,不错点左上角的“Prev page”或“Next page”。
是以IL-10基因的3'UTR序列等于:
ACACATCAGGGGCTTGCTCTTGCAAAACCAAACCACAAGACAGACTTGCAAAAGAAGGC
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因为3'UTR在基因末尾,是以要把经由条往下拉,就能看到了。如下图蓝色标识部分。
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是以IL-10基因的5'UTR序列等于:
GACATCAGGGTGGCGACTCTATAGACTCTAGGACATAAATTAGAGGTCTCCAAAATCGGATCTGGGGCTCTGGGATAGCTGACCCAGCCCCTTGAGAAACCTTATTGTACCTCTCTTATAGAATATTTATTACCTCTGATACCTCAACCCCCATTTCTATTTATTTACTGAGCTTCTCTGTGAACGATTTAGAAAGAAGCCCAATATTATAATTTTTTTCAATATTTATTATTTTCACCTGTTTTTAAGCTGTTTCCATAGGGTGACACACTATGGTATTTGAGTGTTTTAAGATAAATTATAAGTTACATAAGGGAGGAAAAAAAATGTTCTTTGGGGAGCCAACAGAAGCTTCCATTCCAAGCCTGACCACGCTTTCTAGCTGTTGAGCTGTTTTCCCTGACCTCCCTCTAATTTATCTTGTCTCTGGGCTTGGGGCTTCCTAACTGCTACAAATACTCTTAGGAAGAGAAACCAGGGAGCCCCTTTGATGATTAATTCACCTTCCAGTGTCTCGGAGGGATTCCCCTAACCTCATTCCCCAACCACTTCATTCTTGAAAGCTGTGGCCAGCTTGTTATTTATAACAACCTAAATTTGGTTCTAGGCCGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGTGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCCTAACCAGCCTGGTCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCATGGTGGCGCGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAAGAGAATTGCTTGAACCCAGGAGATGGAAGTTGCAGTGAGCTGATATCATGCCCCTGTACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACTCTGTCTCAAAAAATAAAAATAAAAATAAATTTGGTTCTAATAGAACTCAGTTTTAACTAGAATTTATTCAATTCCTCTGGGAATGTTACATTGTTTGTCTGTCTTCATAGCAGATTTTAATTTTGAATAAATAA ATGTATCTTATTCACATCA母狗 拳交
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